Οι κάτοικοι του Νοτίου Σουδάν έχουν τη δυνατότητα να συνεχίσουν σπουδές τριτοβάθμιας εκπαίδευσης είτε σε ένα πανεπιστήμιο ή μια επαγγελματική σχολή. Αν υπάρχει έλλειψη και των δύο οργάνων, πολλά προγράμματα είναι σε θέση να επεκτείνει το τρέχον τοπίο της τριτοβάθμιας εκπαίδευσης στο Νότιο Σουδάν.

Ένα μεταπτυχιακό πιστοποιητικό είναι ένα αρκετά σύντομο εκπαιδευτικό πρόγραμμα που μπορεί να κερδίσει από τους μαθητές που έχουν ήδη πτυχίο συνεργάτης ή πανεπιστημίου. Με την ολοκλήρωση αυτού του ακαδημαϊκού προγράμματος, οι μαθητές βελτιώσουν τις εξειδικευμένες γνώσεις τους, και μπορεί να είναι σε θέση να κερδίσουν περισσότερα χρήματα στην επιλεγμένη σταδιοδρομία τους.